小分子蛋白的WB該如何？

WB（WesternBlot）是一種常用的生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)，用于檢測(cè)和分析蛋白樣品中特定蛋白質(zhì)的存在和表達(dá)水平。它通過(guò)將樣品中的蛋白質(zhì)分離并轉(zhuǎn)移到膜上，然后使用特定的抗體識(shí)別目標(biāo)蛋白，并通過(guò)化學(xué)或免疫檢測(cè)方法來(lái)可視化這些蛋白質(zhì)。WesternBlot技術(shù)通常包括樣品制備、SDS-PAGE電泳分離、蛋白轉(zhuǎn)印、封閉和抗體檢測(cè)、曝光顯影等步驟。目前WB被廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究中，用于研究蛋白質(zhì)表達(dá)、翻譯后修飾以及蛋白質(zhì)相互作用等。

圖1.WB流程圖

在日常實(shí)驗(yàn)過(guò)程中，小分子蛋白是非常常見(jiàn)的，小分子蛋白是指待檢測(cè)的蛋白分子量小于20kda，常見(jiàn)的凋亡蛋白如Bcl2、Caspase-3、Bax，自噬相關(guān)蛋白如LC3B等均為小分子蛋白，這類蛋白由于較小的分子量，易受到凝膠網(wǎng)孔的影響在電泳過(guò)程中彌散，導(dǎo)致難以分離和檢測(cè)。因此，為了檢測(cè)到小分子量的蛋白，需要對(duì)實(shí)驗(yàn)步驟進(jìn)行一些優(yōu)化，以提高實(shí)驗(yàn)成功率。

1. 配膠：整體配膠遵循蛋白分子量越小膠濃度越大的原則，對(duì)于小分子蛋白來(lái)說(shuō)，分離膠濃度一般為12%-15%，對(duì)于小分子蛋白條帶可以分的更加清晰。同時(shí)在倒膠時(shí)濃縮膠的比例可以適當(dāng)增加到4：6，使其充分濃縮，后續(xù)電泳過(guò)程中一定程度上可以減少?gòu)浬ⅰ?/span>15-20kda可選擇12%的凝膠；10-15kda可選擇13.5%的凝膠；小于10kda的蛋白用15%的凝膠或者用Tricine-SDS-PAGE凝膠電泳體系。與傳統(tǒng)的Gly-SDS-PAGE相比，Tricine-SDS-PAGE使用三羥甲基氨基甘氨酸（Tricine）代替甘氨酸（Gly），具有更好的小分子蛋白分離效果。

2. 上樣：根據(jù)日常上樣經(jīng)驗(yàn)，建議在跑小分子蛋白時(shí)增加1倍上樣量，防止蛋白彌散過(guò)多。選擇marker時(shí)，選擇適用于小分子蛋白的marker，后續(xù)敷抗體時(shí)可以更清楚的進(jìn)行裁膜。電泳開(kāi)始前可用1′loadingbuffer補(bǔ)齊未點(diǎn)樣的膠孔，防止兩邊不齊跑成“八"字。

圖1：賽默飛marker示意圖（左：常規(guī)蛋白marker；右：小分子蛋白marker）

3. 電泳：濃縮膠部分設(shè)置恒壓70V、30min左右，一般即可濃縮到一條線上之后調(diào)大電壓至110V，至所需蛋白區(qū)域全部分開(kāi)為止。盡量避免長(zhǎng)時(shí)間低電壓跑膠，易導(dǎo)致蛋白彌散過(guò)多。同時(shí)整個(gè)電泳過(guò)程中注意降溫。

4. 轉(zhuǎn)膜：由于小分子蛋白分子量小，吸附能力弱，因此轉(zhuǎn)膜時(shí)選擇0.22μm的PVDF膜，常規(guī)0.45μm膜容易穿透，剩余條件同正常蛋白一般可以滿足條件。

5. 封閉：快速封閉液或脫脂牛奶按正常條件封閉即可。裁膜時(shí)根據(jù)marker上下留出足夠多的空間。

6. 一抗孵育：在保證上述條件的基礎(chǔ)上，一抗是出好結(jié)果的關(guān)鍵一步，若沒(méi)前期實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)，一抗的稀釋比一般按照說(shuō)明書配置，若有前期實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn)，可適當(dāng)進(jìn)行比例調(diào)整，一抗?jié)舛冗^(guò)高最后顯影階段易出現(xiàn)雜帶，過(guò)低則可能看不到條帶。使用1′TBST緩沖液稀釋，4℃孵育過(guò)夜。

7. 后續(xù)二抗比例及孵育時(shí)間、顯影按常規(guī)操作即可。需要注意若抗體不好用或者蛋白難出結(jié)果，在敷完一二抗時(shí)可適當(dāng)延長(zhǎng)洗膜時(shí)間及次數(shù)。

注意事項(xiàng)：

1. 轉(zhuǎn)膜時(shí)，若蛋白分子量過(guò)小，可適當(dāng)提高甲醇比例（30%左右）改善吸附能力。

2. 跑小分子蛋白時(shí)marker盡量不跑到一張膜上，對(duì)于常見(jiàn)內(nèi)參GAPDH、Actin及Tubulin等來(lái)說(shuō)，分離膠濃度大上述蛋白區(qū)域一般分不開(kāi)或分離不完整，易導(dǎo)致內(nèi)參不齊。

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