影響質(zhì)粒構(gòu)建實驗的因素

　　質(zhì)粒最早是20世紀50年代初期在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)的，是細菌、酵母菌、放線菌等生物中獨立于染色體(或擬核)以外的閉合環(huán)狀雙鏈DNA分子，具有自主復制能力，可在子代細胞中保持恒定的拷貝數(shù)，并表達所攜帶的遺傳信息。那么你知道影響質(zhì)粒構(gòu)建實驗的因素有什么嗎？讓我們一起來看看吧！
 

　　一、載體的選擇
 

　　在選取克隆載體時應留意以下幾點：
 

　　①具備自主復制能力，拷貝數(shù)量眾多；
 

　　②攜帶易于篩選的選擇標記；
 

　　③含有多種限制酶識別序列，以供外源基因插入；
 

　　二、引物設(shè)計留意事項
 

　　在構(gòu)建質(zhì)粒時，設(shè)計引物時應考慮引物長度、引物的GC含量、引物的Tm值等因素，并避免引物間出現(xiàn)配對突變或次級結(jié)構(gòu)等情況。
 

　　前向引物：5’端–上游克隆載體末端同源序列 + 基因正向擴增引物 --3’端
 

　　反向引物：3’端–基因反向擴增引物 + 下游克隆載體末端同源序列 --5’端
 

　　在運用PCR擴增目的基因的過程中，引物設(shè)計需留意事項：
 

　　① 引物長度最好在18-30bp左右，常用的長度是 20-22bp；
 

　　②引物 Tm 值最好在 60℃ 左右，兩條引物間 Tm 值要保持接近，相差最好不要超過 5°C；
 

　　③GC 的含量標準通常為 40%-60% 或45-55%；
 

　　三、酶切位點的選擇
 

　　在構(gòu)建質(zhì)粒時，選擇適當?shù)那懈蠲负瓦B接酶至關(guān)重要。對于切割酶的選擇，應該考慮到酶切位點的位置以及酶的反應條件等因素。而對于連接酶的選擇，則應根據(jù)所使用的質(zhì)粒載體和目標基因的大小來確定。
 

　　①選擇質(zhì)粒上兩個酶切位點之間的距離不宜過小(>10bp)，否則會影響限制性內(nèi)切酶對切點的識別，從而不利于空載體的雙重酶切。
 

　　②在克隆表達目的基因的情況下，選擇酶切位點時應考慮以下因素：
 

　　目標基因片段內(nèi)不應含有所選酶切位點(否則在檢驗陽性重組子的雙重酶切時可能會切斷目標基因)。
 

　　③在后續(xù)實驗中使用的所有載體(真核、原核、酵母、昆蟲)盡可能含有所選的酶切位點，并且要確保插入載體時的方向正確(即定向克隆)，以免在更換載體進行表達時需要重新設(shè)計引物以引入新的酶切位點。
 

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